Das Gymnasium der Kanti Wattwil schliesst an die 2. Sekundarklasse an und führt in vier Jahren zur Maturitätsprüfung. Angeboten wird auch eine Talentklasse Sport mit verlängerter Ausbildungsdauer. Die Fachmittelschule der Kanti Wattwil schliesst an die 3. Klasse der Sekundarschule an und führt in drei Jahren zu einem interkantonal anerkannten Fachmittelschulausweis. Damit steht einem universitären Studium beziehungsweise dem Zugang zu einer Fachhochschule nichts mehr im Weg.
Mit einem Neubau der Kanti Wattwil auf dem Areal der heutigen Aussensportanlagen Rietstein sowie der Erneuerung und Erweiterung des Berufs- und Weiterbildungszentrums Toggenburg (BWZT) an der Bahnhofstrasse werden künftig beide Schulen einzelne Teile der Infrastruktur (insbesondere die Aula, die Mensa, die Küche und die Sportanlagen) gemeinsam nutzen können. Damit entsteht ein innovativer und einmaliger Campus, der viele Vorteile in sich vereint.